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DGGE微生物多样性分析

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普通的聚丙烯酰胺凝胶电泳只能通过片段大小不同在同一浓度的胶上电泳迁移率不同而分离不同的DNA片段,对于片段大小接近或相同的DNA片段无法做到有效地分离;DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis) 即变性梯度凝胶电泳,是利用DNA在不同浓度的变性剂中解链行为的不同而导致电泳迁移率发生变化,从而将片段大小相同而碱基组成不同的DNA片段分开。


DGGE作为一种成熟的分子生物学技术被广泛应用于环境科学(土壤、海洋、河流、冰川、淤泥等)、医学(各种疾病治疗前后,病变部位微生物的差异)、人体(鼻咽、口腔、黏膜、肠道)等领域进行微生物多样性分析。PCR-DGGE微生物多样性分析技术可用于各种微生物生态系统包括土壤、活性污泥、人体和动物肠道、温泉、极地、植物根系、海洋湖泊、油藏等等的多样性进行半定量和定量分析。

 

技术优势:

1、采用成熟的PCR-DGGE技术快速的对样品进行微生物多样性分析,对测序结果进行处理,保证序列的有效性和准确性,便于后期测序结果的生物信息学分析。

2、掌握了成熟的PCR-DGGE实验方案,拥有完善的实验数据分析平台。

 

实验周期:

根据不同客户的要求,实验周期也不尽相同。我们在接到客户提供的样品后,即刻进行实验,至全部实验及数据分析结束,一般控制在16-20个工作日内完成。

 

送样要求:

1、环境样品

1)送样样品尽量保证新鲜,采样后建议立即冰冻保存。

2)样品在保存期间请勿反复冻融。

3)水样样品若是浑浊请在离心后送沉淀物,若是澄清水样请使用滤膜过滤后,送滤膜进行后续实验;若是样品中含有大量的腐殖质酸、重金属等PCR反应抑制剂,请在送样时注明。

4)请务必填写完整的送样订单,并用自封袋密封后同样品一起送样,以便收到样品后妥善保存。

 

2、环境样品基因组DNA

1)请提供浓度大于10ng/uL,总量大于500ng的基因组DNA,OD260/280=1.8-2.0,并确保DNA无降解。

2)样品在保存期间请勿反复冻融。

3)送样务必标清楚样品编号,并用parafilm膜对管口进行密封。

4)请务必填写完整的送样订单,并用自封袋密封后同样品一起送样,同时将基因组DNA的照片发送至service@genenode.com

 

3、寄送样品:

1)请按照我们的订单填写要求填写订单,并随样品一起寄送。

2)若是自己寄送快递,请在寄送快递前与公司联系,以便样品及时查收,妥善处理,避免不必要的麻烦。